Ense gehört zur Ev. Kirchengemeinde Ense. Kleine Teile des Gebietes der Gemeinde Ense gehören zu anderen evangelischen Kirchengemeinden:

• Die Ortschaften Bilme und Bittingen gehören zur Ev. Kirchengemeinde Meiningsen.
• Die Ortschaften Sieveringen, Volbringen und Radberg gehören zur Ev. Kirchengemeinde Ostönnen.